Omdat water een hoge soortelijke warmtecapaciteit heeft, stijgt de temperatuur na absorptie van de warmte van het cilinderblok niet veel. De warmte van de motor wordt daarom via het koelvloeistofcircuit afgevoerd, waarbij water als warmtegeleider fungeert voor warmtegeleiding. Vervolgens vindt er via de grote warmteafvoer door convectie warmteafvoer plaats, waardoor de dieselgenerator op de juiste bedrijfstemperatuur blijft.
Wanneer de watertemperatuur van de dieselgenerator hoog is, pompt de waterpomp herhaaldelijk water rond om de temperatuur van de motor te verlagen (de watertank bestaat uit een holle koperen buis. Het hete water stroomt de tank in, koelt af en circuleert naar de cilinderwand van de motor) om de motor te beschermen. Als de watertemperatuur in de winter te laag is, stopt de watercirculatie om te voorkomen dat de temperatuur van de dieselgenerator te laag wordt.
De watertank van een dieselgenerator speelt een zeer belangrijke rol in het gehele generatorsysteem. Onjuist gebruik van de watertank kan schade aan de dieselmotor en de generator veroorzaken, en in ernstige gevallen zelfs leiden tot het afschrijven van de dieselmotor. Daarom is het essentieel dat gebruikers leren hoe ze de watertank van hun dieselgenerator correct moeten gebruiken.